Управлением Федеральной службы исполнения наказаний Российской Федерации по Алтайскому краю на протяжении многих лет сотрудничает с Алтайским филиалом Российской академии народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации. Взаимодействие ведется в рамках договора о сотрудничестве и организации практической подготовки обучающихся на базе УФСИН.